两个版本会出现不同的宝可梦

《宝可梦 剑》与《宝可梦 盾》之间存在各种版本差异，比如一部分登场宝可梦会有所不同。
单首龙、心鳞宝会出现在《宝可梦 剑》里，幼基拉斯、黏黏宝则会出现在《宝可梦 盾》里。